Необходимо написать плагин для программы ImageJ, который будет обрабатывать изображения. Программа изначально предназначена для работы с изображениями и имеет открытый исходный код JAVA. По сути плагин должен просто выполнять алгоритм действий после получения на вход изображения (развернуть, выделить спектр(эта часть плагина уже готова), найти максимумы и подставить значения в готовую формулу и т.п.). Более подробную информацию смогу предоставить при общении со специалистом.